Les Vitraux
 

Lors de la  première phase de construction en 1895, on plaça une série de grisailles dans les fenêtres supérieures. Elles sont actuellement invisibles suite au placement d'un faux plafond provisoire.
En 1897-1898 l'atelier de Contini plaça le vitrail de la façade baroque représentant la Sainte Trinité, les trois vitraux ovales des occultants et les vitraux des nefs latérales.Peu de renseignements concernant Louis de Contini sont arrivés jusqu'à nous.
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En 1908, quand s'acheva la construction de l'église, on plaça dans la nef encore deux derniers vitraux semblables à ceux réalisés par Contini. Ceux-ci auraient été réalisés par un maître verrier anversois  dénommé Peyes.
Il aurait également livré les fenêtres provisoires du transept et des façades latérales du chœur. Au même moment Contini plaça 4 vitraux dans le chœur dont un seul en hauteur existe encore.

Les nombreuses armoiries et inscriptions des vitraux rappellent les donateurs et des familles belges illustres.
Dans le vitrail du baptême du Christ, outre les armoiries de l'Ordre de Malte et l'emblème de l'église de la Trinité, figurent celles des communes d'Ixelles et de Saint-Gilles.

En 1933, Louis Charles Crespin peintre d'intérieurs d'églises et de portraits, créa les dessins des 9 vitraux du chœur du transept. Il les a fait dans le style et le caractère du bâtiment, ce qui est unique dans son oeuvre.
L'Ordre de Malte a pris en charge l'installation des 2 vitraux du transept et le vitrail central du chœur représentant le Baptême du Christ.

L'Institut Royal du Patrimoine Artistique(IRPA) a procédé en 2003-2004-2005 à une étude approfondie  des vitraux. La conclusion générale de l'IRPA est que les vitraux sont relativement en bon état et qu'ils peuvent pour le moment rester tel quel.

Leur classement comme patrimoine permettrait de faire une restauration approfondie et très professionnnelle.